Jej zainteresowania naukowe obejmują m.in. epidemiologię chorób alergicznych i astmy u dzieci, wpływ czynników środowiskowych i mikrobioty na rozwój alergii, a także nowoczesne podejścia terapeutyczne, w tym immunoterapię swoistą i fitoterapię w profilaktyce infekcji dróg oddechowych. Jest autorką i współautorką licznych publikacji naukowych oraz artykułów popularyzatorskich w uznanych czasopismach.
Dr Ewa Willak-Janc jest cenioną prelegentką konferencji i szkoleń medycznych, w ramach których dzieli się wiedzą i doświadczeniem klinicznym z pediatrami oraz lekarzami innych specjalności. Jej wystąpienia wyróżniają się praktycznym podejściem, aktualnością wiedzy oraz umiejętnością łączenia teorii z realnymi wyzwaniami codziennej pracy lekarza.